孔林是孔子及其后代的墓地，因孔子被封為“文宣王”后稱宣圣林，改封“至圣先師”后改稱至圣林，習慣的叫法稱為孔林。孔林是我國目前保存年代最長、面積最大、歷史延續性最完整的氏族墓地。
孔子于魯哀公十七年（公元前479年）去世，據漢司馬遷（《史記·孔子世家》）記載：“葬魯城北泗上”，大體上是現今位置。其墓冢封土為偃斧形，高四尺，僅比地面略微高出，并無祠堂等建筑。弟子們于墓前以磚瓦砌成祠壇，規模很小，方僅六尺。西漢武帝時董仲舒提出“罷黜百家、獨尊儒術”的建議被采納后，孔子的林墓也受到了重視。為顯示弘揚圣道，歷代王朝相繼修林植樹，不斷地擴大墓園，添加建筑，設官守衛，使孔林成為世界上保持年代最久的家族墓地。自漢以來，歷代對孔林重修，增建過13次，增植樹木5次，擴充林地3次，從而形成了現在孔林的規模。
孔林占地面積三千余畝（約二百余萬平方米），有孔子及其歷代子孫的墓葬十余萬座；漢、宋、明、清、民國墓碑4003通（現在新立碑未統計），其中有趙孟頫、李東陽、黃養正、嚴嵩、翁方綱、何紹基、阮元、康有為等人題寫的碑文；石人、石馬、石獸、望柱等石儀85對；歷代栽植的樹木42000余株（民國晚期到現在栽植的未統計）；門、坊、享殿、碑亭等二十余座。孔林的埋葬在二千四百余年中全無間斷，延續時間之久，墓葬數目之多，保存之完好，作為氏族墓葬區在世界上也是絕無僅有的一處，這也是儒家思想在中國漫長的封建社會中居統治地位的必然產物。
孔林內墓冢累累，碑碣如林，石儀成群，古木參天，地上地下文化遺產豐富，林內既可考春秋之葬、證秦漢之墓，又是研究我國東方墓葬制度的沿革，研究我國古代政治、經濟、文化、風俗、書法演變、藝術的博物館。
萬古長春坊及明代碑亭
萬古長春坊位于城北門外至孔林的大門的神道中間。此坊為石質結構，明萬歷二十二年（公元1594年），巡按連標、巡撫鄭汝璧建。清雍正年間重修加固。此坊系六柱五間五樓，廡殿頂。坊頂雕瓦垅及脊獸，檐下雕有斗拱。額坊、立柱、花板遍布精美的雕刻，柱、坊深浮雕，花板淺浮雕。坊額刻于明間花板上，正書“萬古長春”四個大字，筆勢沉厚，字體端莊。石柱前后用石抱鼓，鼓上浮雕石獅子，兩側面上分別浮雕龍、鹿、牡丹等圖案。此坊矗立于神道上，雄偉精美。
在“萬古長春”坊前東、西側各有一座碑亭。東面內立《大成至圣先師孔子神道碑》，明萬歷二十二年（公元1594年）冬十一月，山東巡撫鄭汝璧、巡按連標立。西側碑亭內立《闕里重修孔子林廟碑》，碑文為明萬歷年間，禮部尚書、東閣大學士、東阿人于慎行書，立于明萬歷二十三年六月二十二日。
至圣林坊、大門
此坊在孔林大門前，原名叫“宣圣林”坊，于清雍正七年（公元1729年）和孔廟同時改為“至圣”。坊建于明永樂二十二年（公元1424年），經明、清兩代的多次重修，現在仍然保持明代早期的建筑特點。此坊四柱三間三樓式木制牌坊，綠琉璃瓦廡殿頂，前后檐下皆用雕刻精制的斗拱，彩畫精細，十分精美。坊前有明崇禎七年（公元1634年）雕刻的石獅一對。
孔林的正門，位于至圣林坊后，門屋三間，明間留有車道。兩次間筑于高臺之上（臺高約1.10米），是宋、元時期流行的陵園建筑方式。此門為元至順二年（公元1331年）所建。大門兩次間圍木欄，立有元至順三年（公元1332年）三月《重修宣圣林神門記碑》1通，明、清兩代修林記事碑5通。
二林門
二林門前以甬道與大門相連接。此門為魯國故城的北門（龍門）遺址，元代至順二年（公元1331年）始建，明弘治七年（公元1494年），六十一代孫、衍圣公孔弘泰添建門樓，“神門隘陋也，架以樓觀”。現存觀樓五間，重檐綠瓦歇山頂，無斗拱，下檐四周有回廊，廊柱下置鼓礅柱礎。清雍正十年（公元1732年）、1964年重修。門前石欄內放有石獅一對，均為明崇禎七年（公元1634年）雕刻。
孔林二門觀樓不但是重要的文物地，也是革命歷史紀念地。1948年10月5日至10月10日，《淮海戰役曲阜會議》也曾在此召開過。會議由粟裕主持，參加會議的有饒漱石、張鼎丞、陳士榘、張震、韋國清、許世友等，會議主要部署傳達毛澤東起草的《關于淮海戰役的作戰方針》和重要指示的電報文。會議原在孔廟奎文閣舉行，10月9日晚移入孔林二門觀樓舉行，在此共六天時間。
洙水橋坊、株水橋
位于孔子墓軸線的最南端，坊四柱三間，石質，四柱均為沖天八楞式，柱頂各有圓雕石獸，獨角披麟，仰天蹲座。明間額坊雕刻“洙水橋”三個正書大字，二次間均淺刻二龍戲珠。此坊造型簡樸莊重，明嘉靖二年（公元1523年），山東巡撫陳鳳梧建立。
洙水橋三字沒有書寫者的落款，據傳說為嚴嵩所書。嚴嵩孫女嫁給六十四代孫、衍圣公孔尚賢為一品夫人，他曾在孔林為六十一代孫、衍圣公孔弘泰題寫墓碑。
洙水橋位于石坊之后，孔子墓軸線南端。此橋寬6.6米，長25.24米，橋面呈拱形，遮住了人們北望的視線，以示孔子墓深藏于內。洙水橋建于金代以前或者金代。明弘治七年（公元1494年），六十一代孫、衍圣公孔弘泰增設橋石欄桿，并于左右兩側添建兩座小橋，均有石欄桿，因橋為平型，習慣稱為“東平橋”、“西平橋”。
墓門
墓門位于洙水橋的北面，孔子墓軸線的中部。門屋三間，三開門，黃瓦懸山頂，檐下有斗拱，兩側出八字墻，前有8級臺階，后有6級，如同陽宅之門。門基高約1.31米左右，用以擋住人們的視線，故又稱“檔墓門”。墓門始建于東漢永壽三年（公元157年），金代時期位于今享殿處，明永樂十二年（公元1414年）重建移入今位置，清代初期重修。
孔子墓甬道
過墓門之后，便可看到甬道兩旁的石雕。其石雕共有四對八件，名曰華表、文豹、甪端、翁仲，華表又稱望柱，上面雕有蓮花盆，盆上放一鼓腹縮口花瓶，下有蓮座，是進入墓地的標志，以示天門；文豹，想象動物，形象似豹，其獸溫順善良，能腋下噴火，用其守墓以示安詳、尊嚴；甪端，也是一種想象中的怪獸，傳說世上出現此獸是大吉之事，并傳它能通四方語言，知曉遠方及幽避之處事，日行一萬里，夜行八千里；翁仲，石人像，為秦代著名驍將，威震邊塞，有他鎮守邊塞，其他的部落不敢造次，有時少數部落造反，由其帶兵去，不打自亂，后來演變成文、武二人將其守墓，以示安寧。以后為對稱，雕成文武兩像，均稱翁仲。現翁仲為清雍正十年（公元1732年）刻制，原宋宣和年間刻制的翁仲移孔伋墓前。兩對石獸及望柱均為宋宣和五年（公元1123年）雕刻。
享殿
過甬道石雕后便是享殿，此殿是祭祀孔子時排擺香壇、宣讀祭文的地方。享殿為明弘治七年（公元1494年）六十一代孫、衍圣公孔弘泰建。明萬歷二十二年（公元1594年）重修，清雍正九年（公元1731年）重修時改為黃琉璃瓦，以示達到最高等級。現存建筑五間，單檐黃瓦歇山頂，前有廊，殿內及廊下天花板均為貼金云龍。室內置供案，存有清世宗雍正修孔林“綸言”碑和清高宗乾隆御制詩碑，詩碑四面刻乾隆五次謁孔林詩五首。
享殿既是祭祀孔子的圣地，又是革命歷史紀念地。1950年月日10月29日—31日，中國人民解放軍第九兵團在曲阜召開抗美援朝軍事動員大會。會議由兵團司令兼政委宋時輪主持，參加會議的有副司令員陶勇、參謀長譚健、政治部主任謝有發以及團以上干部。30日上午，會議在享殿前舉行，朱總司令受毛澤東主席委托，代表黨中央、中央軍委到會做抗美援朝、保家衛國的動員報告。享殿為山東省重點文物保護單位。
楷樹及楷亭
此樹位于享殿之后，墓道東側，為孔子弟子子貢所植（姓端木，名賜，字子貢，衛國人）。樹前有石碑一通，上寫“子貢手植楷”。此樹是孔子去世后，其弟子子貢在守墓時所植。其他弟子守墓三年各自離去，唯子貢守墓六年。為紀念其高尚的尊師品德，所以歷代對其植樹加以保護。因子貢外出經商，返回后，孔子已奄奄一息，孔子去世后，子貢用六年時間守墓以彌補不在老師身邊盡弟子孝心之過。傳說，子貢對仕途不感興趣，決定辭官經商。征求孔子意見，孔子重文輕商，對子貢的做法認為是“不務正業”。子貢沒有聽從，選擇了自己的道路，成為著名的商人，所以二千多年來，商人供奉子貢的牌位，文人墨客及學堂供孔子牌位，泥、木、鐵、石匠人供魯班牌位。
楷亭位于楷樹之東側，紀念子貢手植樹的建筑，楷亭為清康熙年間所建，亭呈方形，四面空透，不設墻欄。亭內立有楷圖碑，是清初遭雷擊后，其樹干無損，清康熙五十一年（公元1712年），把樹形刻于石碑。
孔子死后，由其弟子們葬于“魯城北泗上”。孔子墓是孔林內最主要的墓葬，位于孔林中部略偏南段。其墓雖經年代之久，封土至今仍有5米多高，東西30多米，南北28米。墓前有石碑兩通（一高一低），前面的碑篆書“大成至圣文宣王墓”，碑陰正書“奉政大夫修正庶尹禮部郎中賜食三品祿直文淵閣永嘉黃養正書”，下款書“大明正統八年歲次癸亥十月一日五十九代孫襲封衍圣公孔彥縉五十八代孫承事郎曲阜世職知縣孔公堂等立石”，此碑立明正統八年（公元1443年）。后面石碑篆書“宣圣墓”三字，上款正書“門生益津高？書”，下款書“甲辰春二月既望五十一代孫元措立石”。甲辰年，為蒙古乃馬真后三年（公元1244年）。
墓前的石臺，初為漢修，唐代時改為泰山運來的封禪石筑砌，清乾隆時又予擴大。另外有明代刻的石供案，清雍正十年（公元1732年）刻制的石鼎。
子貢廬墓處
子貢廬墓處在孔子墓西側，為紀念子貢守墓六年而建。面東，三間，建于明嘉靖二年（公元1523年），清康熙年間重修。當年在此守墓條件十分艱苦，蘆草柵以遮寒暑，而子貢守墓六年之久，受世人所敬仰。其尊師之品德，對當今的尊師重教也有著啟迪的作用。
孔鯉墓
孔鯉墓位于享殿之后，直對享殿后面的甬道。墓前石碑2通，前碑正書“泗水侯墓”，此碑明代所立。后有一小碑，篆書“二世祖墓”，為蒙古乃馬真后三年（公元1244年）五十二代孫、衍圣公孔元措立。墓前有石供案，磚砌拜臺。
孔子兒子孔鯉，名鯉，字伯魚。據說孔子十九歲娶宋國亓官氏為妻，婚后年余得子，魯昭公為念孔子系“以勇力聞于諸侯”的叔梁紇之后，又以知書達禮小有名氣，因此派人送給孔子鯉魚以賀喜，孔子為表達對魯君的恩賜的感激之情，給兒子取此名，以至讓后人世代不忘，充分說明孔子的忠君思想。
孔鯉生于公元前532年，卒于公元前483年，享年51歲。自幼深受孔子教誨，其“不學詩，無以言”，“不學禮，無以立”的故事，至今仍傳為美談。魯哀公曾以幣招他做官，他稱疾不仕。宋崇寧元年（公元1102年）因其“親聞詩禮，魯堂從祀”，被封為“泗水侯”。
孔伋墓
孔伋墓在孔子墓南20余米處的高土臺上。墓前石碑2通，前碑正書“沂國述圣公墓”，此碑為明代所立。后面小碑篆書“三世祖墓”，為五十一代孫、衍圣公孔元措（公元1244年）立。前面石供案為明代刻制，石鼎為清雍正十年（公元1732年）刻制。拜臺前有宋宣和年間雕刻翁仲一對，雍正年間移于此。
孔伋，字子思，孔子之孫，生于公元前483年，卒于公元前402年，享年八十二歲。戰國初期著名的思想家、哲學家、儒家學派的代表人物。自幼立志于繼承家學，相傳孔子閑居而嘆，孔伋即問孔子：“意子孫不修將祖乎？羨堯舜之道不反乎？”當孔子說：“爾孺子安知吾志”時，孔伋回答說：“亟聞夫子之教，其父析薪，其子弗克弗荷，是謂不肖。伋每思之，所以大怒而不懈也”。孔子高興了，“然乎？吾無憂矣。世不廢業，其克昌乎？”（《孔子家語•記問》），相傳孔伋曾受業于曾參，游于衛、宋諸國，晚年返歸魯國。一生授徒著書，著有《子思子》一卷九篇。《子思》二十三篇，早已亡佚。相傳《禮記》中的“中庸”、“坊記”、“表記”等為其作品，孔伋繼承和發展了孔子的中庸思想，建立了以中庸思想為核心的學說。孔子將中庸當作最高的道德準則，孔伋將中庸系統化。在認識論上，主張“執兩用中”、“擇乎中庸”，在方法論上，主張格致中和，處理事情不偏不倚。無過無不及；在宇宙觀上，認為“誠”是宇宙萬物的根源，“誠者，天之道也”，“誠者，物之終始，不誠無物”。至誠才能盡人之性，盡物之性。相傳孟子曾受業于孔伋的門人，將孔伋思想加以發揮，成為戰國時期的顯學之一即思孟學派。《論語》、《中庸》、《大學》、《孟子》成為儒家的代表性經典。因孔伋“圣人之道，孟氏之師，作為《中庸》，萬世宗仰”。宋崇寧元年（公元1102年）被封為“沂水侯”，南宋咸淳三年（公元1267年）加封為“沂國公”，元至順元年（公元1330年）加封為“沂國述圣公”，明嘉靖九年（公元1530年）改稱“述圣”。子思除在孔廟大成殿配享外，在鄒城還建有“中庸書院”專祠，以衍圣公次子主持祀事，并被封為世襲翰林院五經博士。
孔令貽墓
孔令貽墓位于孔林內東北角，緊靠林墻。墓前石碑篆書“孔子七十六代孫襲封衍圣公燕庭先生之墓”。碑文由前國務總理、外交總長、稅務督辦、姻弟孫寶琦題寫。中華民國十年一月，襲封衍圣公德成立。孫寶琦乃孔令貽夫人孫氏之弟。
孔令貽生于1872年，卒于1919年，享年48歲，字谷孫，號燕庭，孔子七十六代孫，清光緒三年（公元1877年），襲封衍圣公，備受清廷優渥。光緒十四年（公元1888年）年滿十六歲首次入京見帝，并賞賜“福”、“壽”各一張，并將皇帝御書孔廟“斯文在茲”額奉回曲阜。光緒二十年（公元1894年），奉母偕妻入京為慈禧太后祝壽，親受皇帝召見，母、妻留住御園，慈禧多次召見，親同家人，賞給御書“壽”字，“松鶴、蟠桃”圖等，孔令貽此行并獲“賞戴雙眼花翎”之榮。民國期間，受到歷任總統的優遇，1913年，袁世凱頒給“一等大綬寶嘉禾章”，袁世凱稱帝后甚至加給郡王銜。1919年11月8日，因背瘡病逝于北京，大總統徐世昌命派專列將靈柩送回曲阜，孔令貽忠心報效朝廷，光緒三十二年（公元1906年）“奉旨稽查山東全省學務”，先后到山東各州府考察，為地方教育做出一定的貢獻。在曲阜古泮池行宮設鄉塾，辦孔顏曾孟四氏師范學堂，自任總理。1914年與康有為等籌建孔教會，提倡尊孔讀經。能詩善畫，書法秀媚。
孔尚任墓
此墓位于孔林東北部，墓碑正文書“奉直大夫戶部廣東清吏司員外郎東塘先生之墓”。碑文由誥授奉直大夫、原任巡撫山東等處地方、督理營田兼理軍務、都察院右副都御史年家眷侄陳世館書寫。清雍正十三年（公元1735年）四月立石。
孔尚任生于1648年，卒于1718年，享年71年，曲阜南辛大湖村人，孔子六十四代孫。字聘之，又字季重，號東塘、岸堂，自稱云亭山人。他幼承家學，膝下受教，后入曲阜孔顏曾孟四氏學堂讀書，成為秀才。屢次鄉試不第，氣憤之下入石門山隱居讀書。清康熙二十年（公元1781年）納貲為國子監生，次年被衍圣公孔毓圻請出山治其夫人張氏喪事，二十二年被委編修《孔子世家譜》和《闕里志》，接著又被委以訓練祭祀禮生和樂舞生。次年康熙帝至曲阜祭祀孔子，祭祀后，命孔尚任進講《大學》首章，深得皇帝的賞識：“經筵之官不及也”，并面諭大學士明珠和王熙，“孔尚任等陳書講說，克副朕懷，不拘定例，額外敘用”，后“從優額外授為國子監博士”。次年入京赴任，第二年被派往淮陽，隨刑事部侍郎孫豐疏浚黃河海口。停工后回京，康熙三十四年（公元1695年）春任戶部福建清吏司主事，三十六年被委監鑄寶泉局，后升任廣東清吏司員外郎，不久被罷官（公元1699年），康熙四十一年（公元1702年）離京重返石門山隱居，晚年曾幾次出游，寄食伴書，景況寂苦。孔尚任博學有文名，通音律，析祖庭典故，著有《闕里志》、《孔子世家譜》、《岸堂集》、《湖海集》、《長留集》、《會心錄》、《節序同風錄》、《小忽雷》、《桃花扇》等，以戲劇成就最高。《桃花扇》是其代表作，也是我國古代戲劇的代表作之一。該劇傾注了他畢生的心血，未出仕前就畫其輪廓，治河期間又結識了冒辟疆、鄧孝威、僧石濤等一批明末遺民，搜集到很多逸聞和史實，使他的創作素材更加充實，創作目的更加明確。回京后，三易其稿，康熙三十八年終于成書。劇本集中反映了明末腐朽、動蕩的社會現實及統治階級內部的矛盾和爭斗，鮮明揭示了南明王朝覆滅的歷史教訓。該劇在京城上演后，“歲無虛日”、“名臣公卿、墨客騷人，駢集者座不容膝”，轟動京師，連皇帝也派內侍索要劇本。正當“方揮桃扇春無限”的時候，他卻突然被罷官。至于其原因，從他的“命薄忽遭文字憎，緘口金人受誹謗”詩看，是因文字遭禍的，后人因此懷疑禍因《桃花扇》。
孔憲培墓、于氏坊
孔憲培墓位于孔林東北部，墓碑篆書“光祿大夫七十二世襲封衍圣公篤齋先生之墓。”碑文由光祿大夫軍機大臣董誥題。清嘉慶十九年（公元1814年）三月，襲封衍圣公慶镕，孫繁灝立石。甬道南端建有木制牌坊“鸞音褒德”坊，俗稱“于氏坊”。
于氏坊建有清道光五年（公元1825年）。道光三年十二月二十八日，孔憲培元配夫人于氏去世。于氏為于敏中之女，傳清高宗之女，五年皇帝派人御祭，七十三代衍圣公建立此坊，將祭文刻于正面，背面刻“鸞音褒德”四字，以歌頌于氏。
孔憲培生于1756年，卒于1793年，享年38歲。本名憲允，乾隆三十六年（公元1771年），高宗賜名憲培，字養元，號篤齋，孔子七十二代孫。乾隆三十五年賞給二品頂戴，四十七年襲封衍圣公。五十年誥授光祿大夫。憲培倍受乾隆皇帝優渥，三十六年蒙乾隆留京善撲處親軍治愈足癡。三十七年入京迎娶于氏，又蒙皇恩召見，并賞御膳。憲培工詩、善畫、能書，詩為古今體；畫花鳥尤于墨蘭；書學蘇黃。無子，以其胞弟憲增之長子慶镕為嗣。
明墓群
過于氏坊西偏南便到了明墓群。墓群內墓冢累累，碑碣如林，石儀成群，明弘治年間吏部尚書李東陽，嘉靖年間吏部尚書嚴嵩等所書寫的石碑立于其間。墓群是明代衍圣公集中埋葬的地方，是明代初時新開林地，所以孔府主人去世后便不斷地埋葬于此，自五十八代孫、衍圣公孔公鑑至六十五代孫、衍圣公孔衍植，共有八代衍圣公在此埋葬。其中六十一代孫、衍圣公有二位，即孔弘緒、孔弘泰兄弟二人。孔弘泰生于1450年，卒于1503年，享年54歲，字以和，號東莊，孔子六十一代孫，明成化六年（公元1470年）代兄弟弘緒襲衍圣公。
